На сегодняшний день в состав Оренбургского областного клинического противотуберкулёзного диспансера входят два поликлинических отделения и стационар на 400 коек.
Так же при диспансере имеются вспомогательные подразделения: оперблок из трёх операционных; отделение анестезиологии и реанимации на 6 коек; рентгенологическое отделение, включающее в себя 4 рентгенкабинета, 2 кабинета УЗИ, 2 передвижных флюорографа; лечебно-диагностическое отделение, состоящее из кабинета функциональной диагностики, кабинета физиотерапии, кабинета лечебной физкультуры и массажа, зубного кабинета; клинической, биохимической и бактериологической лаборатории; эндоскопический кабинет; патологоанатомическое отделение; аптека; централизованное стерилизационное отделение; приемный покой; оргметодотдел.
При диспансере работают: столовая для сотрудников, буфет для персонала, зубной кабинет для персонала. В каждом отделении есть комнаты психологической разгрузки для врачей и отдельно для среднего и младшего персонала.
Отделения диспансера: консультативная поликлиника для взрослых на 380 посещений в день, детская поликлиника на 100 посещений в день, отделение для больных туберкулезом органов дыхания № 1 на 70 коек, отделение для больных туберкулезом органов дыхания № 2 на 70 коек, отделение для больных туберкулезом, сочетанным с ВИЧ-инфекцией № 3 на 60 коек, отделение для больных туберкулезом органов дыхания № 4 на 40 коек, туберкулезное легочно-хирургическое отделение № 5 на 50 коек, хирургическое отделение для больных туберкулезом внелегочной локализации № 6 на 70 коек, отделение для больных туберкулезом органов дыхания детского и подросткового возраста № 7 на 40 коек.
Главный врач - Шамшурин Михаил Геннадьевич