В настоящий момент в структуру Севастопольской городской инфекционной больницы включены приемное отделение, четыре отделения, предназначенные для стационарного лечения инфекционных больных, амбулаторно- поликлиническое отделение "Центр профилактики и борьбы с ВИЧ/СПИД", консультативно-диагностическое отделение, отделение реанимации и интенсивной терапии в которых проходят лечение дети и взрослые с такими диагнозами, как: острые пневмонии, кишечные и нейроинфекции, вирусные гепатиты, острые респираторно-вирусные инфекции, бронхиты, коклюш, корь, герпетические инфекции, ветряная оспа, краснуха, малярия, лептоспироз, болезнь Лайма и другие.
Главный врач - Матяж Инга Александровна